男性生殖器畸形包括很多，有的先天性畸形只影响生育力，如单纯性输精管缺如，而有的还可能影响到性功能;有些畸形看上去并不严重如包茎，但处理不当同样能造成严重后果。

　　1.先天性无阴茎畸形

　　本病是因生殖结节发育不全所致。此种患者除无阴茎外，还可能合并其他泌尿生殖器直肠与肛门心血管系统以及下肢畸形。对于能够成活下来的患者来说，的治疗方法是转归为女性，其手术包括睾丸切除及外阴成形等。

　　2.隐匿阴茎畸形

　　本病多见于肥胖体型的人(阴囊肿大造成者除外)。患者常因肥胖导致阴茎发育异常，出现包茎及阴茎发育短小等症。除影响排尿外，对性生活影响也较大。其治疗方法是进行综合性减肥治疗，必要时可实施阴茎成形术并辅以内分泌治疗。儿童患者应尽量在青春期前完成手术。

　　3.双阴茎畸形

　　本症是因胚胎期阴茎始基发育障碍所引起的，常合并其他畸形，如双膀胱双直肠以及肛门脊柱等部位的畸形。治疗单纯性双阴茎畸形比较简单，可保留较粗壮的一侧而将另一侧切除。

　　4.大阴茎畸形

　　大阴茎畸形者的阴茎长度和直径均较正常者大。大阴茎畸形患者还常常合并内分泌系统的其他疾病。治疗这种患者一般是采用部分切除阴茎海绵体的缩小手术。

　　5.蹼状阴茎畸形

　　蹼状阴茎是指阴茎皮肤全长附着于阴囊而使阴茎无法勃起并影响排尿的一种畸形，一些患者还合并尿道下裂或性别畸形。可根据具体情况选择阴茎成形术或尿道下裂修补术进行治疗。

　　6.包茎

　　这是临床常见的男性生殖器先天性畸形。两种畸形的包皮虽然都覆盖阴茎，但是有包茎者其包皮不能翻至龟头以上。